Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FXNQ16595 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FXNQ16595 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FXNQ16595 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FXNQ16595 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FXNQ16595 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FXNQ16595 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FXNQ16595 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FXNQ16595 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FXNQ16595 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FXNQ16595 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FXNQ16595 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FXNQ16595 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FXNQ16595 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FXNQ16595 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FXNQ16595 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FXNQ16595 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FXNQ16595 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FXNQ16595 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FXNQ16595 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FXNQ16595 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FXNQ16595 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FXNQ16595 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FXNQ16595 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FXNQ16595 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FXNQ16595 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FXNQ16595 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FXNQ16595 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FXNQ16595 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FXNQ16595 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FXNQ16595 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FXNQ16595 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FXNQ16595 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FXNQ16595 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FXNQ16595 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FXNQ16595 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FXNQ16595 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FXNQ16595 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FXNQ16595 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FXNQ16595 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FXNQ16595 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FXNQ16595 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FXNQ16595 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FXNQ16595 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FXNQ16595 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FXNQ16595 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FXNQ16595 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FXNQ16595 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FXNQ16595 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FXNQ16595 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FXNQ16595 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FXNQ16595 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FXNQ16595 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FXNQ16595 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FXNQ16595 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FXNQ16595 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FXNQ16595 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FXNQ16595 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FXNQ16595 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FXNQ16595 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FXNQ16595 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FXNQ16595 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FXNQ16595 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FXNQ16595 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FXNQ16595 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FXNQ16595 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FXNQ16595 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FXNQ16595 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FXNQ16595 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FXNQ16595 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FXNQ16595 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FXNQ16595 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FXNQ16595 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FXNQ16595 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FXNQ16595 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
FXNQ16595 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FXNQ16595 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FXNQ16595 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FXNQ16595 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FXNQ16595 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FXNQ16595 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FXNQ16595 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FXNQ16595 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
FXNQ16595 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FXNQ16595 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FXNQ16595 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FXNQ16595 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FXNQ16595 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FXNQ16595 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FXNQ16595 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FXNQ16595 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FXNQ16595 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FXNQ16595 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FXNQ16595 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FXNQ16595 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FXNQ16595 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FXNQ16595 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FXNQ16595 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FXNQ16595 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FXNQ16595 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
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