Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms