Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
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