Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
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