Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
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