Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms