Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
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