Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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