Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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