Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
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