Protein–RNA interactions for Protein: Q14691

GINS1, DNA replication complex GINS protein PSF1, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1Q14691 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GINS1Q14691 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GINS1Q14691 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GINS1Q14691 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GINS1Q14691 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GINS1Q14691 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GINS1Q14691 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GINS1Q14691 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GINS1Q14691 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GINS1Q14691 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GINS1Q14691 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GINS1Q14691 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GINS1Q14691 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GINS1Q14691 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GINS1Q14691 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GINS1Q14691 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GINS1Q14691 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GINS1Q14691 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GINS1Q14691 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GINS1Q14691 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GINS1Q14691 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GINS1Q14691 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GINS1Q14691 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GINS1Q14691 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GINS1Q14691 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GINS1Q14691 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GINS1Q14691 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GINS1Q14691 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GINS1Q14691 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GINS1Q14691 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
GINS1Q14691 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
GINS1Q14691 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
GINS1Q14691 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms