Protein–RNA interactions for Protein: Q14690

PDCD11, Protein RRP5 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,871 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD11Q14690 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
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