Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
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COL4A6Q14031 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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COL4A6Q14031 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
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COL4A6Q14031 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
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COL4A6Q14031 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
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COL4A6Q14031 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
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COL4A6Q14031 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
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