Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PKP1Q13835 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PKP1Q13835 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PKP1Q13835 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PKP1Q13835 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PKP1Q13835 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PKP1Q13835 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PKP1Q13835 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PKP1Q13835 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PKP1Q13835 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PKP1Q13835 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PKP1Q13835 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PKP1Q13835 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PKP1Q13835 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PKP1Q13835 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PKP1Q13835 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PKP1Q13835 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PKP1Q13835 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PKP1Q13835 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PKP1Q13835 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PKP1Q13835 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PKP1Q13835 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PKP1Q13835 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PKP1Q13835 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PKP1Q13835 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PKP1Q13835 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PKP1Q13835 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PKP1Q13835 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PKP1Q13835 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PKP1Q13835 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PKP1Q13835 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PKP1Q13835 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PKP1Q13835 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PKP1Q13835 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PKP1Q13835 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PKP1Q13835 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PKP1Q13835 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PKP1Q13835 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PKP1Q13835 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PKP1Q13835 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PKP1Q13835 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PKP1Q13835 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PKP1Q13835 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PKP1Q13835 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PKP1Q13835 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PKP1Q13835 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PKP1Q13835 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PKP1Q13835 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PKP1Q13835 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PKP1Q13835 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PKP1Q13835 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PKP1Q13835 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PKP1Q13835 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PKP1Q13835 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PKP1Q13835 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PKP1Q13835 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PKP1Q13835 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PKP1Q13835 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PKP1Q13835 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PKP1Q13835 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PKP1Q13835 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PKP1Q13835 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PKP1Q13835 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PKP1Q13835 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PKP1Q13835 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PKP1Q13835 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PKP1Q13835 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PKP1Q13835 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PKP1Q13835 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PKP1Q13835 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PKP1Q13835 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PKP1Q13835 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PKP1Q13835 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PKP1Q13835 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PKP1Q13835 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PKP1Q13835 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PKP1Q13835 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PKP1Q13835 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PKP1Q13835 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PKP1Q13835 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PKP1Q13835 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PKP1Q13835 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PKP1Q13835 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PKP1Q13835 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PKP1Q13835 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PKP1Q13835 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PKP1Q13835 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
PKP1Q13835 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
PKP1Q13835 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
PKP1Q13835 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PKP1Q13835 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PKP1Q13835 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PKP1Q13835 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PKP1Q13835 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PKP1Q13835 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PKP1Q13835 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PKP1Q13835 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PKP1Q13835 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PKP1Q13835 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PKP1Q13835 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
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