Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
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