Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HTR4Q13639 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HTR4Q13639 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HTR4Q13639 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HTR4Q13639 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HTR4Q13639 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HTR4Q13639 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
HTR4Q13639 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
HTR4Q13639 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HTR4Q13639 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HTR4Q13639 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HTR4Q13639 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HTR4Q13639 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HTR4Q13639 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HTR4Q13639 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
HTR4Q13639 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HTR4Q13639 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HTR4Q13639 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HTR4Q13639 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HTR4Q13639 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HTR4Q13639 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HTR4Q13639 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HTR4Q13639 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HTR4Q13639 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HTR4Q13639 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HTR4Q13639 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
HTR4Q13639 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HTR4Q13639 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HTR4Q13639 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
HTR4Q13639 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HTR4Q13639 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HTR4Q13639 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HTR4Q13639 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HTR4Q13639 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HTR4Q13639 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HTR4Q13639 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HTR4Q13639 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
HTR4Q13639 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HTR4Q13639 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HTR4Q13639 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HTR4Q13639 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
HTR4Q13639 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
HTR4Q13639 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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