Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms