Protein–RNA interactions for Protein: Q13522

PPP1R1A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1A, humanhuman

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Length 171 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1AQ13522 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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