Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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