Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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