Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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