Protein–RNA interactions for Protein: Q13371

PDCL, Phosducin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCLQ13371 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PDCLQ13371 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDCLQ13371 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms