Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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