Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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