Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
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