Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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