Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
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