Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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