Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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