Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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