Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms