Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms