Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPOCK1Q08629 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPOCK1Q08629 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPOCK1Q08629 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPOCK1Q08629 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPOCK1Q08629 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPOCK1Q08629 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPOCK1Q08629 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SPOCK1Q08629 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SPOCK1Q08629 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPOCK1Q08629 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPOCK1Q08629 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SPOCK1Q08629 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPOCK1Q08629 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPOCK1Q08629 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPOCK1Q08629 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPOCK1Q08629 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPOCK1Q08629 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPOCK1Q08629 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms