Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms