Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms