Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms