Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms