Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms