Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CYP27A1Q02318 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms