Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms