Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
DEFA6Q01524 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
DEFA6Q01524 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
DEFA6Q01524 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
DEFA6Q01524 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms