Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms