Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMF1P82094 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMF1P82094 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMF1P82094 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMF1P82094 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMF1P82094 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMF1P82094 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMF1P82094 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMF1P82094 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMF1P82094 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMF1P82094 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMF1P82094 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMF1P82094 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TMF1P82094 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMF1P82094 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TMF1P82094 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMF1P82094 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TMF1P82094 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMF1P82094 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMF1P82094 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMF1P82094 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMF1P82094 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMF1P82094 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMF1P82094 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMF1P82094 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMF1P82094 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMF1P82094 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMF1P82094 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMF1P82094 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMF1P82094 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TMF1P82094 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMF1P82094 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMF1P82094 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMF1P82094 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMF1P82094 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMF1P82094 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMF1P82094 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMF1P82094 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMF1P82094 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMF1P82094 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMF1P82094 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMF1P82094 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMF1P82094 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TMF1P82094 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMF1P82094 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMF1P82094 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMF1P82094 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMF1P82094 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMF1P82094 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMF1P82094 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMF1P82094 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TMF1P82094 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMF1P82094 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TMF1P82094 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TMF1P82094 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMF1P82094 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMF1P82094 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMF1P82094 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMF1P82094 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMF1P82094 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMF1P82094 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMF1P82094 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMF1P82094 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMF1P82094 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMF1P82094 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMF1P82094 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMF1P82094 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMF1P82094 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMF1P82094 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMF1P82094 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMF1P82094 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMF1P82094 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMF1P82094 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TMF1P82094 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TMF1P82094 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TMF1P82094 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMF1P82094 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TMF1P82094 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMF1P82094 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMF1P82094 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMF1P82094 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMF1P82094 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMF1P82094 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TMF1P82094 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMF1P82094 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TMF1P82094 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TMF1P82094 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TMF1P82094 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TMF1P82094 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TMF1P82094 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TMF1P82094 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMF1P82094 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMF1P82094 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMF1P82094 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TMF1P82094 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMF1P82094 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMF1P82094 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMF1P82094 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TMF1P82094 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMF1P82094 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms