Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ELF3P78545 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ELF3P78545 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ELF3P78545 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ELF3P78545 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ELF3P78545 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ELF3P78545 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ELF3P78545 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ELF3P78545 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ELF3P78545 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ELF3P78545 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ELF3P78545 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ELF3P78545 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELF3P78545 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELF3P78545 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELF3P78545 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELF3P78545 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELF3P78545 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELF3P78545 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELF3P78545 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELF3P78545 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELF3P78545 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELF3P78545 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELF3P78545 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELF3P78545 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELF3P78545 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELF3P78545 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELF3P78545 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELF3P78545 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELF3P78545 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ELF3P78545 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELF3P78545 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELF3P78545 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELF3P78545 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELF3P78545 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELF3P78545 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELF3P78545 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELF3P78545 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELF3P78545 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELF3P78545 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELF3P78545 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELF3P78545 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELF3P78545 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELF3P78545 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELF3P78545 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELF3P78545 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELF3P78545 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELF3P78545 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELF3P78545 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELF3P78545 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELF3P78545 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELF3P78545 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELF3P78545 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELF3P78545 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELF3P78545 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELF3P78545 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELF3P78545 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELF3P78545 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELF3P78545 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELF3P78545 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ELF3P78545 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELF3P78545 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELF3P78545 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELF3P78545 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELF3P78545 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELF3P78545 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELF3P78545 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELF3P78545 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELF3P78545 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELF3P78545 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELF3P78545 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELF3P78545 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELF3P78545 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELF3P78545 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELF3P78545 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELF3P78545 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELF3P78545 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ELF3P78545 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ELF3P78545 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ELF3P78545 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ELF3P78545 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ELF3P78545 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ELF3P78545 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ELF3P78545 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ELF3P78545 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ELF3P78545 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ELF3P78545 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ELF3P78545 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ELF3P78545 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ELF3P78545 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ELF3P78545 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ELF3P78545 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ELF3P78545 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ELF3P78545 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ELF3P78545 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ELF3P78545 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ELF3P78545 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ELF3P78545 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ELF3P78545 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ELF3P78545 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms