Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms