Protein–RNA interactions for Protein: P62987

UBA52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA52P62987 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBA52P62987 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBA52P62987 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
UBA52P62987 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBA52P62987 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBA52P62987 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBA52P62987 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBA52P62987 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
UBA52P62987 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBA52P62987 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBA52P62987 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
UBA52P62987 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBA52P62987 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBA52P62987 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBA52P62987 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBA52P62987 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBA52P62987 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBA52P62987 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBA52P62987 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBA52P62987 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBA52P62987 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBA52P62987 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBA52P62987 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBA52P62987 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBA52P62987 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBA52P62987 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBA52P62987 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBA52P62987 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBA52P62987 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBA52P62987 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBA52P62987 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBA52P62987 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBA52P62987 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBA52P62987 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBA52P62987 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBA52P62987 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBA52P62987 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBA52P62987 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBA52P62987 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBA52P62987 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBA52P62987 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBA52P62987 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBA52P62987 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBA52P62987 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBA52P62987 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBA52P62987 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBA52P62987 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBA52P62987 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBA52P62987 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBA52P62987 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBA52P62987 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBA52P62987 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBA52P62987 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBA52P62987 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBA52P62987 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
UBA52P62987 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBA52P62987 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBA52P62987 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
UBA52P62987 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
UBA52P62987 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBA52P62987 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBA52P62987 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBA52P62987 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBA52P62987 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBA52P62987 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBA52P62987 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBA52P62987 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBA52P62987 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBA52P62987 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBA52P62987 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBA52P62987 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBA52P62987 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
UBA52P62987 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBA52P62987 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBA52P62987 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBA52P62987 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBA52P62987 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBA52P62987 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBA52P62987 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBA52P62987 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBA52P62987 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBA52P62987 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBA52P62987 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBA52P62987 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBA52P62987 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBA52P62987 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBA52P62987 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBA52P62987 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBA52P62987 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBA52P62987 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBA52P62987 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBA52P62987 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
UBA52P62987 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
UBA52P62987 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBA52P62987 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBA52P62987 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBA52P62987 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
UBA52P62987 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBA52P62987 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBA52P62987 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms