Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VBP1P61758 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VBP1P61758 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VBP1P61758 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VBP1P61758 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VBP1P61758 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VBP1P61758 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VBP1P61758 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VBP1P61758 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VBP1P61758 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VBP1P61758 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VBP1P61758 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VBP1P61758 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VBP1P61758 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VBP1P61758 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VBP1P61758 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VBP1P61758 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VBP1P61758 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VBP1P61758 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VBP1P61758 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VBP1P61758 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VBP1P61758 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VBP1P61758 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VBP1P61758 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VBP1P61758 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VBP1P61758 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
VBP1P61758 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VBP1P61758 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VBP1P61758 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VBP1P61758 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VBP1P61758 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VBP1P61758 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VBP1P61758 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VBP1P61758 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VBP1P61758 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VBP1P61758 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VBP1P61758 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VBP1P61758 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VBP1P61758 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VBP1P61758 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VBP1P61758 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VBP1P61758 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VBP1P61758 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VBP1P61758 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
VBP1P61758 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VBP1P61758 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VBP1P61758 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VBP1P61758 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VBP1P61758 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VBP1P61758 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VBP1P61758 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VBP1P61758 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VBP1P61758 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VBP1P61758 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VBP1P61758 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VBP1P61758 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VBP1P61758 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VBP1P61758 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VBP1P61758 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VBP1P61758 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VBP1P61758 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VBP1P61758 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VBP1P61758 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VBP1P61758 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
VBP1P61758 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
VBP1P61758 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VBP1P61758 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VBP1P61758 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VBP1P61758 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VBP1P61758 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
VBP1P61758 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VBP1P61758 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VBP1P61758 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VBP1P61758 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VBP1P61758 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VBP1P61758 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VBP1P61758 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
VBP1P61758 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VBP1P61758 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VBP1P61758 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VBP1P61758 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VBP1P61758 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VBP1P61758 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
VBP1P61758 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VBP1P61758 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
VBP1P61758 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VBP1P61758 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VBP1P61758 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VBP1P61758 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VBP1P61758 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VBP1P61758 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VBP1P61758 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VBP1P61758 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VBP1P61758 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VBP1P61758 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VBP1P61758 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VBP1P61758 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VBP1P61758 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VBP1P61758 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VBP1P61758 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms