Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVK-21P61565 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms