Protein–RNA interactions for Protein: P61421

ATP6V0D1, V-type proton ATPase subunit d 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V0D1P61421 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP6V0D1P61421 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP6V0D1P61421 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP6V0D1P61421 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP6V0D1P61421 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP6V0D1P61421 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP6V0D1P61421 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP6V0D1P61421 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP6V0D1P61421 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP6V0D1P61421 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP6V0D1P61421 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP6V0D1P61421 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP6V0D1P61421 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP6V0D1P61421 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP6V0D1P61421 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP6V0D1P61421 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP6V0D1P61421 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP6V0D1P61421 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP6V0D1P61421 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP6V0D1P61421 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP6V0D1P61421 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP6V0D1P61421 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP6V0D1P61421 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP6V0D1P61421 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP6V0D1P61421 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP6V0D1P61421 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP6V0D1P61421 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP6V0D1P61421 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP6V0D1P61421 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP6V0D1P61421 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP6V0D1P61421 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP6V0D1P61421 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP6V0D1P61421 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP6V0D1P61421 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP6V0D1P61421 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6V0D1P61421 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6V0D1P61421 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6V0D1P61421 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6V0D1P61421 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6V0D1P61421 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6V0D1P61421 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6V0D1P61421 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6V0D1P61421 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6V0D1P61421 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6V0D1P61421 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6V0D1P61421 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6V0D1P61421 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6V0D1P61421 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6V0D1P61421 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6V0D1P61421 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6V0D1P61421 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6V0D1P61421 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6V0D1P61421 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6V0D1P61421 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6V0D1P61421 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6V0D1P61421 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6V0D1P61421 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6V0D1P61421 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6V0D1P61421 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6V0D1P61421 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6V0D1P61421 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6V0D1P61421 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6V0D1P61421 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6V0D1P61421 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6V0D1P61421 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6V0D1P61421 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6V0D1P61421 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6V0D1P61421 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6V0D1P61421 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6V0D1P61421 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6V0D1P61421 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6V0D1P61421 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6V0D1P61421 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6V0D1P61421 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP6V0D1P61421 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP6V0D1P61421 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP6V0D1P61421 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP6V0D1P61421 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP6V0D1P61421 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP6V0D1P61421 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP6V0D1P61421 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP6V0D1P61421 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP6V0D1P61421 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP6V0D1P61421 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP6V0D1P61421 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP6V0D1P61421 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP6V0D1P61421 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP6V0D1P61421 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP6V0D1P61421 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP6V0D1P61421 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP6V0D1P61421 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP6V0D1P61421 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP6V0D1P61421 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP6V0D1P61421 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP6V0D1P61421 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP6V0D1P61421 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP6V0D1P61421 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP6V0D1P61421 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP6V0D1P61421 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP6V0D1P61421 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms