Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ABCE1P61221 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ABCE1P61221 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ABCE1P61221 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ABCE1P61221 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ABCE1P61221 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCE1P61221 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCE1P61221 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCE1P61221 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCE1P61221 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCE1P61221 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCE1P61221 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCE1P61221 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCE1P61221 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCE1P61221 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCE1P61221 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCE1P61221 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCE1P61221 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCE1P61221 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCE1P61221 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCE1P61221 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCE1P61221 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCE1P61221 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCE1P61221 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCE1P61221 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCE1P61221 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCE1P61221 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCE1P61221 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCE1P61221 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCE1P61221 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCE1P61221 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCE1P61221 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCE1P61221 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCE1P61221 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCE1P61221 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCE1P61221 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABCE1P61221 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABCE1P61221 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABCE1P61221 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ABCE1P61221 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABCE1P61221 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ABCE1P61221 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABCE1P61221 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABCE1P61221 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABCE1P61221 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABCE1P61221 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABCE1P61221 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABCE1P61221 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ABCE1P61221 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABCE1P61221 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ABCE1P61221 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABCE1P61221 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABCE1P61221 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ABCE1P61221 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ABCE1P61221 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ABCE1P61221 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ABCE1P61221 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ABCE1P61221 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ABCE1P61221 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ABCE1P61221 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ABCE1P61221 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABCE1P61221 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABCE1P61221 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ABCE1P61221 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABCE1P61221 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABCE1P61221 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABCE1P61221 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ABCE1P61221 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABCE1P61221 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ABCE1P61221 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABCE1P61221 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABCE1P61221 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABCE1P61221 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABCE1P61221 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABCE1P61221 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABCE1P61221 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABCE1P61221 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABCE1P61221 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABCE1P61221 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABCE1P61221 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABCE1P61221 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABCE1P61221 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms